強直性脊柱炎除關節病變外，大多數在患了脊柱炎以後，少數在患脊柱炎前數月或數年，有部分病人還可以出現如下的一些變化：
(1)虹膜炎
在強直性脊柱炎中較常見，發生率可超過25％，每次發作約4-8周，易反復發作，有的病人可復發數十次，病程越長，發生率越高，而與強直性脊柱炎的嚴重程度無關，但大多發生在合並周圍關節累及的病人中。少數可發生於強直性脊柱炎症狀之前，多數出現在強直性脊柱炎症狀之後。一般為單側性。本病常需局部或全身激素治療，一般對視力影響不大，但若治療不當或延誤治療，也可發生視力障礙。
(2)心血管病變
心血管病變受累雖然少見，但也是強直牲脊柱炎的一個重要表現。屍體解剖發現，約1／4，病人的主動脈根部有異常。臨床上包括上行性主動脈炎、主動脈瓣膜下纖維化、主動脈瓣關閉不全、二尖瓣脫垂以及二尖瓣關閉不全、心髒擴大、房室傳導阻滯和束支傳導阻滯、擴張型心肌病變和心包炎等。
(3)肺部病變
隨著強直性脊柱炎病變發展，腳廓活動受限，可出現兩上肺，尤其是肺尖纖維化、囊性變，甚至有空洞形成。病人可有咳嗽、咳痰、氣短，以及咯血，肺功能檢查肺活量減少。一般發生於病程20年以上的病人。較少見的肺部表現有胸膜增厚粘連、肺門及膈頂模糊、條狀肺膨脹不良等。
(4)神經系統病變
少數病例因脊柱強直以後，並發嚴重的骨質疏松，因此十分容易發生骨折，哪怕輕微的外傷也可引起。脊柱骨折以頸椎最易發生，尤以第5—7頸椎多見，是病死率最高的並發症。第一、二節頸椎半脫位時，可出現頸部嚴重疼痛，常放射至颞部、枕部和眶後。
(5)腎髒損害
極少發生，主要是IgA(免疫球蛋白A)腎病和腎澱粉樣變。
(6)前列腺炎
本病慢性前列腺炎比正常人群多見。
