骨質疏松症的病因較多，尚未完全明了，可能是多種因素綜合作用的結果，也可能只是其中的一種原因所造成的，常見的有遺傳、內分泌、營養、失用、年齡以及免疫等多種因素。
1、營養因素：鈣、磷、蛋白質、微量元素如氟、鎂、鋅等、維生素C、維生素D等的缺乏與骨質疏松密切有關。其中尤以鈣、磷兩種元素缺乏為主要原因。
2、缺少活動：運動、日光照射、重力負荷因素與骨量多少、骨質疏松症的發生有密切關系。運動時，神經內分泌調節對骨骼提供充分的礦物營養，使全身和局部骨鈣含量增加；運動還可以保持對骨骼一定的機械刺激，刺激成骨細胞的活性，增加骨的形成；運動鍛煉還可使絕經期婦女的雌激素分泌輕度增加。
3、遺傳因素：骨量的丟失也與遺傳因素有關，因此，遺傳因素也是骨質疏松症發生的一個重要原因。例如，身材矮小的人較身材高大的易發生骨質疏松症；即使生活條件、身體狀態、環境因素相近、性別相同、年齡相近的兩個人，其骨質疏松症的發生和程度也有差別。
4、內分泌：在內分泌中，含有雌性激素、甲狀旁腺激素、降鈣素、活性維生素D、甲狀腺素、雄激素、皮質類固醇激素、生長激素等，而以前4種激素尤為重要，特別是性激素是起決定性作用的，尤其對婦女的影響更為明顯，例卵巢摘除或過早閉經的女性，由於雌激素分泌減少或不分泌，易發生骨質疏松。
5、失用因素：因骨折或骨病而需長期固定的患者，因患病需長期臥床者，肌肉癱瘓者，可引起骨質疏松症。一般認為，機體長期處於靜止狀態時，肌肉活動減少，骨缺少肌肉刺激，結果骨母細胞減少，正常骨的代謝過程遭到破壞，破骨細胞相對活躍，造成骨骼中的鈣溶出，尿中的鈣排出增加，最終導致骨質疏松症。
