強直性脊柱炎的病因尚未完全明確，但認為和下列因素有關：
1、感染因素：由於類風濕因子是TSR球蛋白的抗體，而TSR球蛋白通常是由感染引起的抗體，故認為類風濕關節炎與某種病毒或其它感染有關。但強直性脊柱炎的患者其類風濕膠乳試驗陽性者不通過10%，而人類白細胞胞抗原即HLA一B27，陽性率可高達96%。有人認為與泌尿系感染有關。
2、基因因素：類風濕者其家族的發病率為正常人的2-10倍，而強直性脊柱炎家族的發病率為正常人的30倍。作者本人在門診中6個月曾見到約5名患者其父或其兄弟也有本病，有一例患者其父親及兩個兒子均患此病，這也說明遺傳基因與本病有一定的關系。
3、內分泌失調戴代謝障礙：由於類風Al多見於女性，而強直性脊柱炎多見於男性，故被認為內分泌失調與本病有關。但利用激素治療類風濕並未取得明顯效果，激素失調與本症的關系也沒有肯定。腎上腺皮質機能亢進的病人患類風濕或強直性脊柱炎的比率無明顯增加或減少。
4、其它因案：年齡、體質、營養不良、氣候、水土、潮濕和寒冷。維生素A、D缺乏等可能與本病有一定的關系，但證據均不足。
本病多由骶髂關節開始，逐漸向上侵犯腰椎、胸椎、最後頸椎。肩、髋、肋椎關節、胸骨柄體、大轉子、坐骨結節、跟骨結節、髂骨峪和恥骨聯合等處也可被累及。大約25%的病人同時患膝、踝等周圍關節病變.初期，滑膜呈多灶性、顯微性炎症改變，中性白細胞浸潤，但病灶中央則以淋巴細胞和白細胞為主。病變沿韌帶小血管擴展。骨沉積反應在纖維結締組織內不經軟骨發育階段便生成。骸骼關節周圍被新生骨殼包繞，關節軟骨呈軟骨內骨化，關節被外圍組織橋固定而強直。病變由散骼關節向上延及脊柱，使脊柱強直。
強直性脊柱炎約10%的患者伴有心髒損害，其特點為主動脈肥厚，纖維化但不融合，其它還有心肌炎、心包炎、冠狀動脈炎。約8%的患者有內髒的澱粉樣變，其中以腎髒澱粉樣變為重要。
