骨結核大多是由肺結核繼發的，但也有患者沒有肺結核病史，屬於結核菌的隱匿性感染。結核菌核大多首先發生在肺部，在肺部感染後通過血液的傳播可以到全身很多系統去，可以導致骨骼系統結核、泌尿系統結核、消化系統結核等。
祖國醫學認為骨痨是由於正氣虛虧，筋骨傷損，氣血失和，蓄結瘀聚化為痰濁，流注骨骼關節而發。
(一)正氣虛虧 腎主骨、藏精、生髓。腎虛則失去精氣的滋養，其正氣下降，易受外邪侵犯。兒童稚陰稚陽之體，氣血、肝腎之氣未盛，或因先天禀賦不足，肝腎虧虛，後天疏於調養，則更致髓弱骨嫩;成人後天失調，傷及脾胃，或因房事過度、遺精帶下， 則使腎虧髓虛骼空，皆可導致人體正氣虛弱，經脈澀滯，液聚日久成痰濁，流注於骨關節而發病。
(二)、筋骨傷損 幼兒筋弱骨嫩，若太早強坐，或因閃挫跌撲，筋骨受損，氣血失和，外邪乘機客於經絡，以至氣血淤滯，蓄積為痰濁，凝聚骨與關節而發病。現代醫學認為骨關節結核屬繼發病變，其原發病變90%以上在肺和骨膜，少數繼發於消化道或淋巴結結核。當結核桿菌侵入骨關節，所引起的局部病理變化與其他部位的結核病變相似，分為滲出期、增殖期、干酪期三期;其後根據治療與否，可出現病變縮小愈合或病變發展擴大兩種情況
