（一）骨質破壞
骨小梁模糊，似磨砂玻璃樣的感覺，呈現出骨質缺損其缺損區為局限性。邊緣相對清晰，可有硬化，是為局限性結核病灶的特點，再繼續以彌散性破壞加劇，易向髓腔拓展而形成結核性骨髓炎。骨質破壞易發生於骨骺及干骺，可在骨質中央部分亦可在邊緣部分，形成缺損，往往骨骺及干骺同時破壞，形成不受骺板限制的統一破壞區。骨結核關節骨質破壞，從兩側邊緣開始，中央的關節板面較輕，是結核的特點。但在膝關節、肩關節中央部分亦可破壞，因緊密相接的軟骨較少。關節骨質破壞上下相對應的關節板面同時受累。但這種接觸面骨質破壞也不一定是為結核所獨有。
（二）骨形改變
管狀長骨的破壞可表現為不同程度的膨脹變形，脊椎的椎體結核、椎體坍塌可呈楔狀變形，椎體上下之間相互嵌入出現駝背或龜背畸形等。
（三）關節改變
關節軟骨被破壞可使關節間隙狹窄，軟骨破壞後不會再生，狹窄發生後會長期存在。脊椎椎間盤破壞不能再生，如破壞明顯，椎間隙永久性消失。
其他較少受累的關節包括：踝關節、足和上肢關節。病人可能有跛行，關節會出現皮溫增高、腫脹及活動范圍減小。關節結核會嚴重影響關節功能，即使經過積極正確的治療，病變也會在某一孤立的部位復發。周圍小關節的結核有時會與其他風濕性疾病相混淆（如痛風和類風濕關節炎）。
