骨髓炎臨床上進入慢性炎症期時，有局部腫脹，骨質增厚，表面粗糙，有壓痛。如有窦道，傷口長期不愈，偶有小塊死骨排出。有時傷口暫時愈合，但由於存在感染病灶，炎症擴散，可引起急性發作，有全身發冷發熱，局部紅腫，經切開引流，或自行穿破，或藥物控制後，全身症狀消失，局部炎症也逐漸消退，傷口愈合，如此反復發作。全身健康較差時，也易引起發作。
由於炎症反復發作，多處窦道，對肢體功能影響較大，有肌肉萎縮;如發生病理骨折，可有肢體短縮或成角畸形;如發病接近關節，多有關節攣縮或僵硬。
X線照片可顯示死骨及大量較致密的新骨形成，有時有空腔，如系戰傷，可有彈片存在。布勞德氏膿腫X線照片顯示長骨干骺端有園形稀疏區，膿腫周圍骨質致密。加利氏骨髓炎骨質一般較粗大致密，無明顯死骨，骨髓腔消失。
慢性骨髓炎的診斷，根據以往有急性骨髓炎或開放性骨折病史，局部病灶檢查及X線片表現，不難確診，但仍需與下列病變鑒別。
(一)結核性骨髓炎 一般多侵入關節，病史較緩慢，有結核病或結核病接觸史等。X線片顯示以骨質破壞為主而少有新骨形成。
(二)骨樣骨瘤 常易診斷為局限性膿腫，但其特征為經常性隱痛，夜間疼痛較重，局部壓痛明顯，但無紅腫，少有全身症狀，X線片可進一步提供鑒別依據。
(三)骨干肉瘤 局部及X線片表現偶可與骨髓炎混淆，但根據發病部位、年齡，臨床表現及X線片特征可資鑒別。
