激素治療紅斑狼瘡時，由於劑量較大，應用時間較長，常出現副反應，而加用中藥後可以明顯減少副反應的發生，常見的副反應有興奮失眠，柯興氏征，骨壞死，高脂血症，糖尿病，胃部疼痛等。患者的興奮可以達到整夜不眠，煩燥，激動，類似精神病發作等，宜配合中醫鎮心寧神治療，應用酸棗仁湯加減，主要藥物有酸棗仁、夜交籐、知母、甘草、朱砂、黃連、琥珀粉、磁石等。
出現柯興氏征，表現有向心性肥胖、滿月臉、痤瘡、多毛等，屬中醫的水虧火旺、濕濁內停，用滋陰清熱、化濕利尿法治療，選用地麥四苓散，主要藥物生地、麥冬、茯苓、澤瀉、豬苓、白術等，激素可引起無菌性骨壞死，多見於骰骨頭及骨關節，出現牽拉性疼痛，繼而出現局部循環障礙，骨壞死，應在停減激素的基礎上加用中醫補腎活血法治療，應用六味地黃丸加味，以牛膝、蜈蚣、杜仲、川斷、毛冬青、接骨木、川穹、丹參、甘草等煎湯送服六味地黃丸治療。激素的另一個副反應是引起血清膽固醇及甘油三酯增高，可以選用瀉濁降脂的中藥，主要有澤瀉、決明子、大黃、山楂、蓮子心、枸杞子等。
激素能促進糖元異生，降低組織對葡萄糖的利用，有一些患者在應用激素治療時會出現藥物性糖尿病，血糖升高，尿糖陽性，還可以出現口渴多食多飲多尿等三多症狀，屬中醫的陰虛內熱症，中藥加用生地、知母、生石膏、花粉等藥，長期服用中藥還可以減少激素升糖的副反應。激素能誘發和加重胃及十二指腸潰瘍，嚴重者可引起出血，加用辛開苦降，和胃理氣的藥物能起到中和與抑制胃酸、調節胃腸動力、保護胃粘膜、消炎止痛的作用，常用藥物為半夏、瓦椤子、佛手片、白豆寇、廣郁金、枳殼等。
